A FCCE foi fundada em 19 de agosto de 1950. É a mais antiga associação de classe privada atuando exclusivamente na área do comercio exterior.
Em agosto de 1990 foi assinado um Protocolo de Cooperação entre a CNC e a FCCE. A partir de então, a FCCE opera coordenadamente com a CNC e trabalha atualmente com 49 câmaras.